LigPlot 2.3.1 下载及安装教程

LigPlot 是一款专门用于展示蛋白质-配体相互作用二维图形的软件，在结构生物学、计算化学和药物发现等方向应用较多。它能够读取 PDB 格式的结构文件，自动检测配体周围的关键残基，并将氢键和疏水作用以二维方式呈现出来。图中氢键通常以虚线表示，疏水接触则以弧形或放射状标记显示，便于快速判断配体与蛋白之间的主要作用类型。LigPlot 最初是命令行工具，后来的 LigPlot+ 版本提供了图形界面，用户可以直接在屏幕上对图形进行拖拽和编辑，操作门槛比早期版本低了不少。软件支持同时处理多个配体-蛋白复合物，方便比较不同配体在同一结合位点上的作用差异。集成的 DIMPLOT 模块可用于分析蛋白-蛋白界面，适合研究多亚基复合物的结合模式。辅助工具 HBADD 能够自动从 PDB 化学组分字典中提取配体信息，简化了准备环节。输出结果默认为 PostScript 格式，也可根据需要转换为其他图片格式。安装完成后，需要设置 PDB 文件目录和临时文件夹路径，配置一次即可长期使用。