手把手教你查询、下载和选择物种参考基因组
- 2026-10-24 17:01:15
手把手教你查询、下载和选择物种参考基因组
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已发表物种参考基因组都会上传到数据库中,大型综合数据库有NCBI(最大、最全面)、Ensembl(大型)和UCSC(https://genome-asia.ucsc.edu/)。还有许多特定物种分类数据库,如植物类数据库phytozome和plaBiPD等,拟南芥、鼠(RGD, http://rgd.mcw.edu)、人、水稻和小麦等模式物种数据库。国内也构建了自己的大型数据库,国家基因组科学数据中心(https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh/)。除了在数据库中检索外,还可以直接根据物种基因组发表文献寻找。下面以NCBI和Ensembl为例介绍如何查询、下载和选择物种参考基因组。
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基因组Genome
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