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读研电脑你买对了吗(生信版)

读研电脑你买对了吗(生信版)

读研电脑你买对了吗(生信版)

好多朋友纠结 mac 到底能不能做生信分析,那么就回答一下大家的问题(仅代表个人看法)
1. 我是研 0 买的 M1 pro 16G。
2. M1 pro 16G 能不能做生信分析?
答:能,我主要做 RNA-seq、TCGA、单细胞、ATAC-seq、CUT&Tag,以上涉及的“下游”分析流程均可流畅运行。
3. 测序的上游分析M1 Pro 能不能做?
答:能,但是不建议,上游往往比下游更耗时,且更占内存,电脑会发烫严重。所以我会选择在服务器上跑完上游,在 mac 上进行下游分析及可视化。
4. 常用软件版本是否不兼容?
答:生信类的软件我没有发现不兼容的,欢迎大家补充,有些实验相关的软件可能存在不兼容。
5. 软件是否很难下载?
答:不会,解决办法就是小红书搜索 mac 软件下载,会有很多网站,实在解决不了,淘宝远程安装。
6. 用 wps 会不会很卡?
答:会,所以用 office。
7. 买 m1 还是 m2 还是 m3?
答:买新不买旧
8. 买多大内存?卡不卡?
答:16G 我目前够用,平时开 10 多个网页,5 个 pdf,R 语言跑单细胞,极少数出现卡顿的情况。不考虑预算的同学可以直接买大内存,一步到位。
9. 跑 10 几万的单细胞行不行?
答:不行,我最多试过 10 万左右,跑 seurat 基本流程,电脑发烫,比较耗时。我一般超过 5 万细胞就上服务器了。
10. 键盘是什么?
答:keychron,已经入了两把。和 mac 很适配。
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