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SnapGene软件使用教程【医学科研干货!】

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SnapGene软件使用教程
SnapGene是一款功能强大的分子生物学软件,适用于PCR、酶切、质粒载体构建、电泳和序列比对等。以下是其基本使用教程的精简版:
一、质粒图谱查看
导入质粒图谱文件,选择“circular”以查看环形图谱。界面上清晰显示酶切位点、开放阅读框(ORFs)及其转录方向、片段名称等信息。
二、左侧功能按钮
Show Enzymes:快速查询和识别酶切位点。
Show Features:隐藏或显示功能序列。
Show Translation:预测序列编码区,并显示氨基酸序列。
Use 3 letter amino acid codes:调整氨基酸密码子显示方式。
三、片段注释
编码序列命名:通过“Feature”→“Add Translated Feature”进行命名和类型选择。
非编码序列命名:如多克隆位点,找到相关酶切位点间的序列进行命名。
四、多序列比对
将包含FASTA序列的txt文件拖入软件,自动识别并拆分序列。使用“Align Multiple Sequences”功能或Ctrl+L快捷键进行比对,查看同源和非同源区域信息。
五、测序结果比对
将测序结果导入SnapGene,利用比对功能进行比对分析。
六、新DNA序列创建
点击“New DNA File”,输入DNA序列并命名。如已有NCBI中的序列,可通过“Import from Genebank”并输入access number导入。对新序列进行注释和编辑。
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